Отдел централизованной бухгалтерии был образован 1 сентября 2017 года, на базе отдела, созданного в 1995 году, который в разные годы назывался:

- отдел финансирования, учета и отчетности органов казначейства главной бухгалтерии;

- отдел финансирования, учета и отчетности органов Федерального казначейства — главная бухгалтерия по операциям федерального бюджета;

- отдел финансового обеспечения;

- отдел централизованной бухгалтерии.

Отдел возглавляли:

- с 1995 года Битюкова Эльвира Алексеевна;

- с 1996 года Розова Любовь Павловна;

- с 2000 года Яковлева Елена Павловна;

- с 2002 года Фисенко Галина Степановна;

- с 2005 года Викулова Елизавета Алексеевна;

- с 2010 года Румак Раиса Ивановна;

- с 2014 года Борисова Елена Дмитриевна.

С 2017 года начальником отдела является Гришанова Ольга Вячеславовна.

Основная функция отдела централизованной бухгалтерии - осуществление полномочий по ведению бюджетного учета и формированию бюджетной отчетности территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство Российской Федерации.

Особенностью отдела является выполнение функции бухгалтерских служб нескольких организаций.

С 1 января 2019 года отдельные функции федеральных органов исполнительной власти, расположенных на территории региона, по ведению бюджетного (бухгалтерского) учета и формированию отчетности начали поэтапно передаваться в УФК по Саратовской области.

Централизация функций дает положительный эффект благодаря внедрению единообразных подходов к ведению бухгалтерского учета и составлению отчетности, прозрачности и повышения качества всех учетных процедур, своевременности и корректности отражения совершенных фактов хозяйственной жизни на счетах бухгалтерского учета. Достижение таких результатов стало возможно, в том числе, благодаря ГИИС «Электронный бюджет», которая позволяет систематизировать всю поступающую информацию о финансовой деятельности федеральных органов исполнительной власти.

Ответственность и профессиональная компетентность позволяют специалистам отдела обеспечить достоверность бюджетного учета федеральных органов исполнительной власти, своевременное формирование бюджетной отчетности и укрепление финансовой дисциплины за счет проактивного подхода к решению поставленных задач.